Les virus usent de procédés multiples pour échapper au système immunitaire et disposer ainsi du temps nécessaire à leur réplication. Au nombre de ces stratégies, on retrouve notamment : l’inhibition de la réponse humorale, l’interférence, l’inhibition et la modulation des interférons, des cytokines, des chemokines et de l’apoptose ainsi que l’échappement au Complexe Majeur d’Histocompatibilité (CMH).

Les virus évoluent en même temps que leur hôte, créant ainsi de nouvelles opportunités et stratégies d’échappement, dont fait bien sûr partie la mutation génétique (SARS-CoV-2 variants).

Lorsque le SARS-CoV-2 pénètre dans la cellule, les récepteurs RIG-I-like (RIG-I et MDA5) ainsi que les récepteurs Toll TLR3, TLR7 et TLR8 impliqués dans l’immunité innée reconnaissent l’ARN simple brin du coronavirus et transmettent le signal en aval aux proteines MAVS (Mitochondrial antiviral-signaling protein), MyD88 (Myeloid differentiation primary response 88) et TRIF (TIR-domain-containing adapter-inducing interferon-β) également impliquées dans la réponse immunitaire. Ce message active la cascade des kinases IKK, laquelle active la réponse inflammatoire via IRF3 (Interferon regulatory factor 3) et NF-κB (Nuclear factor-kappa B), à l’origine de l’expression des IFN-I et des cytokines pro-inflammatoires. C’est dans l’une de ces voies de signalisation que le SARS-CoV-2 parvient à interférer pour échapper à la réponse immunitaire innée attendue.

Différentes protéines accessoires du SARS-CoV-2 semblent capables d’affecter les voies de signalisation de la réponse immune innée et ce à plusieurs niveaux, mais tous convergent vers une inactivation des IFN-1 (par antagonisme avec ses voies de production ou de signalisation).

Génome de SARS-CoV-2 :

 

Génome de SARS-CoV-2

Les premiers retours d’expériences montrent que la production d’IFN-1 est notamment antagonisée lorsque :

 

Le blocage de la signalisation IFN-1 semble quant à elle apparaitre lorsque :

  • Les protéines virales bloquent la phosphorylation de STAT1 (M, nsp1, nsp6, nsp13, ORF3a et ORF7b) ou STAT2 (nsp6, nsp13, ORF7a, and ORF7b)
  • ORF6 inhibe la translocation de STAT1 dans le noyau.
  • De plus, ORF9c semble être capable de réduire les taux de protéines de signalisation IFN

 

On notera également que ORF8 peut réguler à la baisse le CMH-I alors que ORF7a et ORF9c semblent avoir d’autres moyens d’inhiber la présentation de l’antigène.
Enfin, on a montré que ORF3 a induit l’apoptose et inhibe l’autophagie.

Mais il reste bien des choses à découvrir et la recherche continue sur la compréhension mécanismes exacts mis en jeu par SARS-CoV-2 pour échapper au système immunitaire.

Afin de soutenir cette recherche, Interchim® (et ses partenaires comme le fabricant ProSci) propose un large panel d’anticorps, de kits ELISA et de protéines recombinantes en lien avec la recherche contre SARS-CoV-2, ainsi que des échantillons gratuits d’anticorps.

 

Références

Alcami, A., & Koszinowski, U. H. (2000). Viral mechanisms of immune evasion. Immunology Today, 21(9), 447–455. + d’infos

Xia, H., Cao, Z., Xie, X., Zhang, X., Chen, J. Y.-C., Wang, H., Menachery, V. D., Rajsbaum, R., & Shi, P.-Y. (2020). Evasion of Type I Interferon by SARS-CoV-2. Cell Reports, 33(1), 108234. + d’infos

Wu, J., Shi, Y., Pan, X., Wu, S., Hou, R., Zhang, Y., Zhong, T., Tang, H., Du, W., Wang, L., Wo, J., Mu, J., Qiu, Y., Yang, K., Zhang, L.-K., Ye, B.-C., & Qi, N. (2021). SARS-CoV-2 ORF9b inhibits RIG-I-MAVS antiviral signaling by interrupting K63-linked ubiquitination of NEMO. Cell Reports, 34(7), 108761. + d’infos

Flower, T. G., Buffalo, C. Z., Hooy, R. M., Allaire, M., Ren, X., & Hurley, J. H. (2020). Structure of SARS-CoV-2 ORF8, a rapidly evolving immune evasion protein. Proceedings of the National Academy of Sciences, 118(2), e2021785118. + d’infos

Zhou, Z., Huang, C., Zhou, Z., Huang, Z., Su, L., Kang, S., Chen, X., Chen, Q., He, S., Rong, X., Xiao, F., Chen, J., & Chen, S. (2021). Structural insight reveals SARS-CoV-2 ORF7a as an immunomodulating factor for human CD14+ monocytes. IScience, 24(3), 102187. + d’infos

Dominguez Andres, A., Feng, Y., Campos, A. R., Yin, J., Yang, C.-C., James, B., Murad, R., Kim, H., Deshpande, A. J., Gordon, D. E., Krogan, N., Pippa, R., & Ronai, Z. A. (2020). SARS-CoV-2 ORF9c Is a Membrane-Associated Protein that Suppresses Antiviral Responses in Cells. Cold Spring Harbor Laboratory. + d’infos

Ren, Y., Shu, T., Wu, D., Mu, J., Wang, C., Huang, M., Han, Y., Zhang, X.-Y., Zhou, W., Qiu, Y., & Zhou, X. (2020). The ORF3a protein of SARS-CoV-2 induces apoptosis in cells. Cellular & Molecular Immunology, 17(8), 881–883. + d’infos

Miao, G., Zhao, H., Li, Y., Ji, M., Chen, Y., Shi, Y., Bi, Y., Wang, P., & Zhang, H. (2021). ORF3a of the COVID-19 virus SARS-CoV-2 blocks HOPS complex-mediated assembly of the SNARE complex required for autolysosome formation. Developmental Cell, 56(4), 427-442.e5. + d’infos

 

En savoir plus :

  • N’hésitez pas à nous consulter pour bénéficier de nos années d’expérience en immunoessais, immunoréactifs et kits ELISA
  • Consultez notre page dédiée à la recherche SARS-CoV-2